Идея воссоздания Государственного сельскохозяйственного музея, существовавшего в России с середины 19-го века, в части сельскохозяйственных машин была реализована в институте в 1980 году с вводом в строй нового пятиэтажного корпуса.

В экспозицию музея вошли материалы и документы Бюро по сельскохозяйственной механике, сохранившиеся в библиотеке института. Исторический раздел музея был пополнен стендами, объемными макетам и фотоальбомами, представлявшими законченные и освоенные в производстве разработки института в разные годы. Музей института бережно хранит сведения о его предыстории и пути формирования института. В нем представлены основные этапы его создания и развития, биографии выдающихся ученых, которые отдали институту свои знания и опыт и внесли огромный вклад в научное обоснование сельскохозяйственного производства. В начале 2000-х в музее был организован Кабинет ученого, где разместились подлинные предметы мебели, книги, рабочие инструменты трех периодов – довоенного, 50-60-х годов и 70-80-х годов.

Один из разделов музея демонстрирует экспонаты Вычислительного центра института. В музее нашла также отражение общественная деятельность института. Отдельно представлены дипломы и почетные грамоты за значимые научные и конструкторские разработки, подарки от иностранных делегаций.

Специальный раздел музея посвящен Ленинградской плодоовощной опытной станции (ЛПООС), которая была передана институту в 1976 г. Все исторические документы и иллюстративный материал по станции были оформлены в музейную экспозицию в 2010-2012 гг. в библиотеке института.